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細胞核型分析

細胞核型分析:NGS測序法

(NGS測序技術)可檢測23對染色體的數(shù)目異常、1 mb堿基拷貝數(shù)變異,異常細胞比例。

分析說明:
本方法采用高通量測序技術對送檢樣品進行低深度全基因組檢測。先將DNA打斷成150bp左右的片段,再進行全基因組建庫和擴增,用高通量測序平臺進行全基因組測序分析。在進行reads數(shù)統(tǒng)計和GC矯正等數(shù)據(jù)處理之后,以一組正常女性樣品為參考組,采用Z值分析法統(tǒng)計送檢樣品的各個基因組窗口(bin)的Z值,從而實現(xiàn)拷貝數(shù)變異的檢測。

參考文獻:
Leary, RJ, et al. Detection of chromosomal alterations in the circulation of cancer patients with whole-genome sequencing. Sci Transl Med. 2012, 4(162): 162ra154.

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細胞核型分析:G顯帶。

G顯帶核型分析(G-banding karyotyping)是一種經(jīng)典的染色體分析技術,通過顯帶技術顯示染色體上的特征性條帶,用于檢測染色體的數(shù)目和結構異常。以下是關于該技術的詳細介紹:
1. 基本原理
G顯帶:染色體經(jīng)胰蛋白酶處理后,用吉姆薩(Giemsa)染料染色,形成深淺交替的條帶(G帶)。深色帶為富含AT堿基的異染色質區(qū),淺色帶為富含GC堿基的常染色質區(qū)。
核型分析:將中期染色體按大小、著絲粒位置和帶型配對排列,分析是否存在異常。
2. 主要步驟
樣本制備:
來源:外周血淋巴細胞、骨髓細胞、羊水細胞(產(chǎn)前診斷)等。
細胞培養(yǎng):用植物血凝素(PHA)刺激淋巴細胞分裂,秋水仙素阻斷于中期。
染色體顯帶:低滲處理→固定(甲醇:冰醋酸)→滴片→胰蛋白酶消化→Giemsa染色。
顯微鏡觀察:顯微鏡下選擇分散良好的中期分裂相,拍照或數(shù)字化成像。
核型分析:軟件輔助配對染色體,按國際標準(ISCN)命名核型。
3. 應用領域
臨床診斷:染色體數(shù)目異常(如唐氏綜合征:47,XX/XY,+21)。
      結構異常(如易位、缺失、倒位,如費城染色體t(9;22))。
產(chǎn)前診斷:羊水或絨毛膜細胞檢測胎兒染色體異常。
血液病研究:白血病、淋巴瘤的克隆性染色體異常。
不孕不育/流產(chǎn)病因:如克氏綜合征(47,XXY)、平衡易位攜帶者。
4. 結果解讀(示例)
正常女性核型:46,XX
異常核型舉例:唐氏綜合征:47,XY,+21
         慢性髓性白血病:46,XY,t(9;22)(q34;q11.2)
5. 優(yōu)缺點
優(yōu)點:分辨率高(約5-10 Mb),可檢測多數(shù)結構異常。
    成本較低,技術成熟。
局限性:依賴細胞培養(yǎng),耗時(2-3周)。
     無法檢測微小缺失/重復(需結合FISH、微陣列等)。
6. 與其他技術的比較
FISH:針對特定靶點快速檢測,但需已知異常位點。
染色體微陣列(CMA):檢測全基因組拷貝數(shù)變異(CNV),無需細胞培養(yǎng)。
高通量測序(NGS):更高分辨率,但成本高且數(shù)據(jù)分析復雜。
7. 注意事項
樣本質量是關鍵(需足夠的分裂相)。
結果需由專業(yè)遺傳學家解讀,結合臨床表型。
G顯帶核型分析仍是遺傳病和血液腫瘤診斷的基石技術,尤其在資源有限的地區(qū)。對于復雜病例,建議結合多種技術以提高檢出率。
聲明:該文觀點僅代表作者本人.
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