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動(dòng)物物種鑒定

動(dòng)物物種鑒定

通過(guò)DNA barcoding 技術(shù)分析COI基因,可對(duì)動(dòng)物進(jìn)行物種水平的鑒定。某些法醫(yī)應(yīng)用中,則需輔助特定的遺傳標(biāo)記,進(jìn)一步地進(jìn)行分析。該技術(shù)適用單一種屬來(lái)源樣本的分析.

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北京科鑒基因中心

北京科鑒基因中心

等級(jí): [專業(yè)機(jī)構(gòu)]

評(píng)價(jià): 4.9分

中心公告:結(jié)果客觀真實(shí)反應(yīng)??商峁┥祥T采集樣本服務(wù),接收國(guó)內(nèi)外郵寄樣本(僅限個(gè)人鑒定)。同時(shí)提供STR分型檢測(cè)技術(shù)培訓(xùn)和解決方案。

溫馨提示: 周六日提前一天預(yù)約,安排值班接待辦理。

中心地址:北京市海淀區(qū)

辦理時(shí)間:周一到周日:9:00-17:00(周六日提前一天預(yù)約)

  • 項(xiàng)目詳情
  • 鑒定須知
  • 交通位置
  • 平臺(tái)信息
  • 中心點(diǎn)評(píng)(11)
  • 立即預(yù)約

項(xiàng)目用途:??確認(rèn)單一動(dòng)物物種

項(xiàng)目規(guī)格:??DNA barcoding 技術(shù)分析COI基因

檢測(cè)周期:??5-7個(gè)工作日。

辦理方式:??郵寄樣本,上門取樣。

樣本類型:??組織、DNA

樣本要求:??未高溫處理過(guò)

    通過(guò)DNA barcoding 技術(shù)分析COI基因,可對(duì)動(dòng)物進(jìn)行物種水平的鑒定。某些法醫(yī)應(yīng)用中,則需輔助特定的遺傳標(biāo)記,進(jìn)一步地進(jìn)行分析。該技術(shù)適用單一種屬來(lái)源樣本的分析,若樣本為多物種來(lái)源,則采用我公司的CELL STR ID技術(shù)進(jìn)行分析。

NCBI數(shù)據(jù)庫(kù)物種比對(duì)確認(rèn)步驟
使用NCBI數(shù)據(jù)庫(kù)確認(rèn)物種通常涉及序列比對(duì)和物種鑒定。以下是詳細(xì)步驟指南:
 
一、使用BLAST進(jìn)行序列比對(duì)確認(rèn)物種
訪問(wèn)NCBI BLAST
打開(kāi)NCBI網(wǎng)站 (https://www.ncbi.nlm.nih.gov/)
點(diǎn)擊"BLAST"工具或直接訪問(wèn) https://blast.ncbi.nlm.nih.gov/
選擇適當(dāng)?shù)腂LAST程序
核苷酸序列: 選擇"nucleotide BLAST" (blastn)
蛋白質(zhì)序列: 選擇"protein BLAST" (blastp)
對(duì)于未知類型的序列,可選擇"blastx"或"tblastn"
輸入查詢序列
在查詢框中粘貼FASTA格式的序列
或上傳包含序列的文件
設(shè)置數(shù)據(jù)庫(kù)和參數(shù)
數(shù)據(jù)庫(kù)選擇:
核苷酸: "nr/nt" (非冗余核苷酸數(shù)據(jù)庫(kù))
蛋白質(zhì): "nr" (非冗余蛋白質(zhì)數(shù)據(jù)庫(kù))
限制物種范圍(可選): 在"Organism"框中輸入已知或懷疑的物種名稱
其他參數(shù)通??墒褂媚J(rèn)值
運(yùn)行BLAST
點(diǎn)擊"BLAST"按鈕提交任務(wù)
分析結(jié)果
查看"Descriptions"選項(xiàng)卡中的匹配結(jié)果
重點(diǎn)關(guān)注:
E-value (越小越好,通常<0.001)
Query cover (覆蓋度,越高越好)
Percent identity (相似度,越高越好)
檢查匹配物種的學(xué)名和共同信息
 
二、使用NCBI Taxonomy確認(rèn)物種分類
訪問(wèn)NCBI Taxonomy數(shù)據(jù)庫(kù)
直接訪問(wèn) https://www.ncbi.nlm.nih.gov/taxonomy
搜索物種
在搜索框中輸入物種名稱(學(xué)名或俗名)
或輸入Taxonomy ID (如果已知)
查看分類信息
確認(rèn)完整的分類等級(jí)(界、門、綱、目、科、屬、種)
檢查同義詞和常見(jiàn)名稱
查看相關(guān)序列和出版物
 
三、使用其他NCBI工具確認(rèn)物種
NCBI Nucleotide/Protein數(shù)據(jù)庫(kù)
搜索已知的物種特異性標(biāo)記基因(如16S rRNA、COI等)
比較查詢序列與已知物種標(biāo)記的相似性
NCBI Genome數(shù)據(jù)庫(kù)
對(duì)于全基因組或大片段,可比較與參考基因組的相似性
訪問(wèn) https://www.ncbi.nlm.nih.gov/genome/
 
四、多序列比對(duì)確認(rèn)(更精確的方法)
下載多個(gè)相關(guān)物種的同源序列
使用Clustal Omega、MAFFT等工具進(jìn)行多序列比對(duì)
構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育樹(shù)(MEGA、PhyML等工具)
通過(guò)進(jìn)化關(guān)系確認(rèn)物種分類地位
 
注意事項(xiàng)
對(duì)于微生物,16S rRNA基因比對(duì)是常用方法,但可能分辨率有限
對(duì)于高等生物,可考慮使用多個(gè)標(biāo)記基因聯(lián)合分析
相似度閾值參考:
16S rRNA: >97%通常視為同一物種
COI基因: >98%通常視為同一物種
結(jié)合形態(tài)學(xué)、生態(tài)學(xué)等其他證據(jù)進(jìn)行綜合判斷
通過(guò)以上步驟,您可以在NCBI數(shù)據(jù)庫(kù)中有效地比對(duì)序列并確認(rèn)物種分類信息。
平臺(tái)信息

北京司法鑒定平臺(tái)

北京司法鑒定平臺(tái)是是遵照中華人民共和國(guó)司法部頒布的鑒定機(jī)構(gòu)管理辦法,經(jīng)北京司法局核準(zhǔn)登記的專業(yè)司法鑒定機(jī)構(gòu)。

北京司法鑒定平臺(tái)業(yè)務(wù)

鑒定領(lǐng)域:司法親子鑒定、個(gè)人親子鑒定、移民親子鑒定、落戶親子鑒定、胎兒親子鑒定、親緣關(guān)系鑒定、DNA身份識(shí)別、線粒體DNA檢測(cè)、基因身份證、DNA尋親覓祖及種屬鑒定等鑒定項(xiàng)目。

北京科研技術(shù)平臺(tái)

北京科研技術(shù)平臺(tái)是國(guó)內(nèi)早期一批從事DNA檢測(cè)研究的平臺(tái)。其STR分型檢測(cè)技術(shù)較早應(yīng)用親子鑒定和細(xì)胞鑒定,領(lǐng)銜建設(shè)協(xié)助國(guó)內(nèi)多家DNA實(shí)驗(yàn)建設(shè)和人員培訓(xùn),向行業(yè)輸送大量的DNA檢測(cè)研發(fā)工作者。同時(shí)開(kāi)發(fā)了基因檢測(cè)行業(yè)新的多種產(chǎn)品,為STR分型檢測(cè)行業(yè)貢獻(xiàn)力量。在親子鑒定和細(xì)胞鑒定上有著延續(xù)十多年的經(jīng)驗(yàn),同時(shí)產(chǎn)前無(wú)創(chuàng)親子鑒定技術(shù),有著較高的質(zhì)量控制標(biāo)準(zhǔn)。

北京科研技術(shù)平臺(tái)業(yè)務(wù)

鑒定領(lǐng)域:個(gè)人親子鑒定、產(chǎn)前無(wú)創(chuàng)親子鑒定、個(gè)體識(shí)別、人源細(xì)胞STR鑒定、小鼠細(xì)胞STR鑒定、猴源細(xì)胞STR鑒定、倉(cāng)鼠細(xì)胞STR鑒定、種屬鑒定(10/13COI)、動(dòng)植物物種鑒定(單一物種-DNA條形碼技術(shù))、菌種鑒定(16S)、支原體檢測(cè)(PCR法+恒溫法)、種子鑒定(水稻、玉米、大豆、棉花、向日葵、小米、高粱、黃瓜、甜瓜、甘薯SSR分型/開(kāi)發(fā))、核型分析(NGS技術(shù)/G顯帶)、端粒酶活性檢測(cè)、HLA分型、精斑血斑確認(rèn)。

開(kāi)發(fā)產(chǎn)品:小鼠、倉(cāng)鼠、猴源STR分型檢測(cè)試劑;水稻、玉米、大豆、棉花、向日葵、小米、高粱、黃瓜、甜瓜、甘薯SSR分型檢測(cè)試劑

中心點(diǎn)評(píng)(11)

4.8

專業(yè)水平:4.9分服務(wù)水平:4.9分位置環(huán)境:4.8分

全部(20) 交通便利(6) 服務(wù)熱情(5) 法醫(yī)專業(yè)(5) 解讀清晰(3) 還會(huì)再來(lái)(1)

  • 全國(guó)3000多家

    服務(wù)預(yù)約檢測(cè)人次

  • 機(jī)構(gòu)

    司法機(jī)構(gòu)官方授權(quán)預(yù)約合作方

  • 預(yù)約辦理

    檢測(cè)快速處理

  • DNA檢測(cè)預(yù)約指導(dǎo)

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