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DNA親子鑒定-STR基因座及商業(yè)化分型試劑盒的歷史回顧

     短串聯(lián)重復(fù)序列(short tandem repeat,STR)是核心序列為2~6個堿基的短串聯(lián)重復(fù)結(jié)構(gòu)。20世紀(jì)90年代初,STR基因座首次作為一種重要的遺傳標(biāo)記在人類親權(quán)鑒定中被使用(Edwards et a1.,1992; Edwards et a1.,19 91)。第1個STR復(fù)合擴增試劑盒是由英國的法庭科學(xué)服務(wù)部(Forensic Science Se,vice, FSS)研制出來的,包括TH01、vWA、FES/FPS和F13Al共4個基因座 (Kimpton et a1.,1994)。第2個STR復(fù)合擴增試劑盒是由美國AB公司研制出的SGM試劑盒,包括6個基因座,即TH01、vWA、FGA、D8 S1179、D18S51和D21Sll (Kimpton et a1.,1996)。1995年4月,英國采用該試劑盒開始建立國家罪犯DNA數(shù)據(jù)庫(Werrett,1997)。鑒于英國建立國家罪犯DNA數(shù)據(jù)庫的成功和STR分型的廣闊應(yīng)用前景,美國聯(lián)邦調(diào)查局開始籌建美國國家罪犯DNA數(shù)據(jù)庫和聯(lián)合DNA索引系統(tǒng)(CODIS系統(tǒng)),計劃該系統(tǒng)由核心STR基因座組成,并于1996午4月發(fā)起了全國范圍內(nèi)的STR計劃,該計劃持續(xù)了18個月,22個DNA分型實驗室共同對17個候選STR基因座進行了評價,包括群體遺傳學(xué)調(diào)查和有效性檢驗等(Budowle et a1.,1998)。

     為了配合STR計劃,美國Promega公司提供了2個試劑盒:一個是“FFFL”試劑盒,包括F13Al、F13B、FESlFPS和LPL共4個基因座;一個是PowerPlex試劑盒,包括CSFIPO、TPOX、TH01、vWA、D16S539、D7S820、D13 S317和D5 S818共8個基因座。美國AB公司提供了4個試劑盒,各包含3個STR基因座和1個性別位點,分別是:AmpFISTR Blue試劑盒,包括

D3S1358、vWA、FGA; AmpFISTR Green I試劑盒,包括TH01、TPOX、 CSFIPO; AmpFISTR Yellow試劑盒,包括D5S818、D13 S317、D7S820; AmpFISTR Green II試劑盒,包括D8 S1179、D21Sll、D18 S51。后來美國AB公司將AmpFISTR Blue、Green I和Yellow 3個試劑盒合并為一個試劑盒,稱為“AmpFISTR Profiler kit",將AmpFISTR Blue、Green II和Yellow 3個試劑盒合并為另外一個試劑盒,稱為“AmpFISTR Profiler Plus kit"。

     1997年11月13~14日,在STR計劃會議上,確立了13個STR基因座為核心STR基因座,納入CODIS系統(tǒng)。為了全部覆蓋這13個核心STR基因座,美國AB公司推出了AmpFISTR Profiler Plus和Cofiler兩種試劑盒.美國Promega公司推出了PowerPlex l.1和PowerPlex 2.1兩種試劑盒。2000年5月,美國Promega公司研制出了PowerPlex 16試劑盒,除了13個CODIS基因座外還包括2個五核苷酸重復(fù)基因座Penta D和Penta E(Krenke et a1.,2002)。2001年7月,美國AB公司開發(fā)出了Identifiler,除了13個CODIS基因座外還包括2個四核苷酸重復(fù)基因座D2S1338和D19S433 (Collins et a1.,2004)。2007年3月,美國AB公司針對中國人群推出了Sinofiler試劑盒,該試劑盒與Identifiler試劑盒不同的是,用D6S1043基因座和D12S391基因座分別替代了Identifiler試劑盒中TH01基因座和TPOX基因座。

     就國內(nèi)而言,國產(chǎn)化的STR試劑盒研制也是近些年的研究熱點,并取得了一定的進展,如北京基點認(rèn)知公司開發(fā)的GoldeneyerM 20A試劑盒,在CODIS 13個核心基因座的基礎(chǔ)上,增加了基因座Penta E、Penta D、D2S1338、D19S433、D12S3 91和D6S1043,采用五色熒光標(biāo)記技術(shù),一次性擴增19個STR基因座和1個性別基因座,兼容了當(dāng)前DNA鑒定主流試劑盒的全部STR基因座,在單次檢驗中提供了更多的信息量,具有更高的非父排除率和個人識別率??紤]到國產(chǎn)化的趨勢和必然,我國國家質(zhì)量監(jiān)督檢驗檢疫總局及中國國家標(biāo)準(zhǔn)化管理委員會于2009年2月5日頒布了國家標(biāo)準(zhǔn)——《法庭科學(xué)人類熒光標(biāo)記STR復(fù)合擴增檢測試劑質(zhì)量基本要求(GA/T 815-2009)》,規(guī)定了法庭科學(xué)人類熒光標(biāo)記STR復(fù)合擴增檢測試劑質(zhì)量的基本要求,包括試劑基本技術(shù)要求、標(biāo)識、包裝、運輸和儲存。該標(biāo)準(zhǔn)適用于法庭科學(xué)領(lǐng)域使用的人類熒光標(biāo)記STR復(fù)合擴增檢測試劑市場準(zhǔn)入質(zhì)量評價的基本要求。國家安全技術(shù)防范認(rèn)證中心于2009年2月10日頒布了《法庭科學(xué)產(chǎn)品自愿性認(rèn)證實施規(guī)則(DNA檢測試劑產(chǎn)品)》(編號為CSP-V03-005:2009),該規(guī)則以工廠質(zhì)量保證能力檢查、產(chǎn)品抽樣檢測以及獲證后監(jiān)督的方式來保證試劑的質(zhì)量。表1-1對十多年來各種常用的商業(yè)化STR試劑盒進行了統(tǒng)計和概括。

 

聲明:該文觀點僅代表作者本人.
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