在固體支持物上電泳時(shí)，異質(zhì)雙鏈DNA (heteroduplex，HTX)構(gòu)象的變化決定了其電泳遷移率不同于純合雙鏈( homoduplex)?；谶@一原理的HTX分析，主要是把野生型和突變型雙鏈擴(kuò)增產(chǎn)物同時(shí)變性并混合復(fù)性，通過EB染色顯示最終的電泳條帶，分析相應(yīng)序列結(jié)構(gòu)的構(gòu)象所決定的遷移位置變化，進(jìn)而判斷突變的有無。因?yàn)镾SCP技術(shù)不能檢測(cè)沒有導(dǎo)致遷移變異的突變多態(tài)性， HTX分析與SSCP技術(shù)的聯(lián)合使用將會(huì)使結(jié)果更加可信。同時(shí)，HTX方法也避免了同位素的使用。