一方面，在親子關(guān)系爭端事件中，運(yùn)用DNA親子鑒定強(qiáng)化了發(fā)現(xiàn)事實(shí)真相的程度，另一方面，如果缺乏合理的證明責(zé)任分配方式，則可能導(dǎo)致DNA親子鑒定難以運(yùn)用到司法實(shí)踐中來，對(duì)真相的發(fā)現(xiàn)造成困難。因?yàn)橛H子身份關(guān)系的特殊性，對(duì)于親子關(guān)系證明責(zé)任的分配不能像一般民事訴訟中一樣。應(yīng)當(dāng)區(qū)分不同的訴訟類型，具體對(duì)待。
      例如在認(rèn)領(lǐng)之訴中，如果知悉生父符合子女的最佳利益的時(shí)候，不應(yīng)過高設(shè)置原告的舉證責(zé)任，當(dāng)原告有證據(jù)證明被告可能是孩子的生父時(shí)，（例如，被告有事實(shí)上的撫育行為，或者支付撫育金，或者曾與原告同居、發(fā)生過性行為），則應(yīng)當(dāng)由被告就自己與原告子女不存在親子關(guān)系負(fù)舉證責(zé)任。此時(shí)原告可以向法院提出DNA親子鑒定請(qǐng)求，或者法院依職權(quán)主動(dòng)進(jìn)行DNA親子鑒定，如果遭到被告拒絕，則應(yīng)當(dāng)由被告承擔(dān)舉證上的不利益。
      在婚生否認(rèn)之訴中，若要否認(rèn)婚生推定，則要求達(dá)到較高的證明程度。原告不僅要提出確切的證據(jù)，證明婚生子女可能非原告之子女。而且，當(dāng)原告提出親子鑒定要求，被被告拒絕時(shí)，法院不得以此為理由，擬制原告與婚生子女不存在親子關(guān)系，應(yīng)當(dāng)根據(jù)現(xiàn)有證據(jù)的證明力，依自由心證原則，做出裁決。同時(shí)，對(duì)于不同的案件，做出相應(yīng)的平衡。在應(yīng)當(dāng)排除婚生推定的場合，例如妻子懷胎時(shí)間少于180天、夫妻雙方長期分居沒有受孕的可能，生母與夫之家庭已經(jīng)破裂且沒有恢復(fù)的可能時(shí)，應(yīng)當(dāng)對(duì)婚生推定加以限制。此時(shí)，可以依據(jù)“事實(shí)解明義務(wù)”說，即當(dāng)不能期待負(fù)有舉證責(zé)任的當(dāng)事人對(duì)事實(shí)進(jìn)行解明時(shí)，在一定條件下，承認(rèn)對(duì)方當(dāng)事人負(fù)有對(duì)事實(shí)進(jìn)行解明的義務(wù)。若雙方當(dāng)事人一方拒絕配合協(xié)作進(jìn)行親子鑒定，對(duì)于不配合鑒定者應(yīng)當(dāng)承擔(dān)對(duì)于事實(shí)進(jìn)行說明解釋的義務(wù)，若沒有盡到說明的義務(wù)，則應(yīng)當(dāng)認(rèn)定對(duì)其不利的事實(shí)，以減輕原告的證明責(zé)任，平衡雙方證明責(zé)任。