大多數(shù)情況下，親子鑒定中性別位點(diǎn)Amelogenin是生物樣本性別分型的有效方法，但結(jié)果不是完全可靠。親子鑒定中Y染色體Amelogenin的稀有缺失可導(dǎo)致得到Y染色體擴(kuò)增產(chǎn)物。在這種情況下，男性樣本可錯(cuò)誤認(rèn)為是女性。在印度人群中，Y染色體Amelogenin缺失比偶?xì)W洲或非洲人群更常見。澳大利亞DNA數(shù)據(jù)庫中3萬名男性的研究顯示只有6名個(gè)體無Y染色體Amelogenin擴(kuò)增產(chǎn)物。這些個(gè)體通過使用Y-STR和擴(kuò)增SRY區(qū)域可確認(rèn)為男性。

    男性個(gè)體中還沒發(fā)現(xiàn)了親子鑒定中X染色體Amelogenin等位基因的缺失。此時(shí)，只有在Y染色體Amelogenin擴(kuò)增產(chǎn)物。這一現(xiàn)象在7000個(gè)男性的檢驗(yàn)中只出現(xiàn)了3例，可能是有STR商品試劑盒中引物結(jié)合區(qū)的稀有多態(tài)性所致。用檢測X染色體上6bp缺失的引物進(jìn)行擴(kuò)增，可同時(shí)得到X和Y染色體的Amelogenin等位基因。