親權(quán)鑒定中要求STR基因座具有較低的突變率，這是因?yàn)檎J(rèn)同孩子和假設(shè)父親之間的關(guān)系式基于等位基因在代間傳遞時(shí)保持一致的假設(shè)。認(rèn)識(shí)到突變對(duì)于親子鑒定的重要性，有學(xué)者把解決這一問題考慮為需要多少個(gè)STR基因座才能排除父權(quán)，并建議排除父權(quán)至少應(yīng)當(dāng)依靠3個(gè)STR基因座。事實(shí)上，檢測(cè)的STR基因座越多，檢測(cè)到STR突變的概率也越大。由于STR分析通常檢驗(yàn)13個(gè)或更多的基因座，孩子和真正的生物學(xué)父親之間存在2個(gè)甚至更多的突變也并不奇怪。北京科鑒基因親子鑒定中心建議當(dāng)發(fā)現(xiàn)1至3個(gè)基因座不符合遺傳規(guī)律，考慮可能存在突變時(shí)，應(yīng)增加檢測(cè)STR基因座。任何情況下，不能僅依據(jù)一個(gè)STR基因座不符合遺傳規(guī)律來排除父權(quán)。

    當(dāng)然，高的突變也有利于保持STR基因座的多態(tài)性，在人來個(gè)體識(shí)別中很有應(yīng)用價(jià)值。雖然突變可以潛在影響親子鑒定的參照樣本，但它對(duì)受害者自身或犯罪現(xiàn)場(chǎng)證據(jù)之間的直接對(duì)比沒有影響，因?yàn)榘l(fā)生的任何突變?cè)谝粋€(gè)個(gè)體重一生中都會(huì)保持不變。