DNA分子標記是能反映生物個體或種群間基因組中某種差異特征的DNA片段。此DNA片段是將基因組DNA經(jīng)過限制性內切核酸酶切割和分子雜交貨PCR擴增后在電泳凝膠阿航檢測的。與前三種遺傳標記相比，DNA分子標記具有諸多優(yōu)點，包括：

     1、能對生物各發(fā)育時期的個體、組織、器官和細胞進行檢測，直接以DNA的形式表現(xiàn)，不受環(huán)境影響，不存在基因表達與否的問題；

     2、 數(shù)量豐富，遍及整個基因組；

     3、遺傳穩(wěn)定，多態(tài)性高；

     4、對生物體的影響表現(xiàn)為“中性”，不影響目標性狀的表現(xiàn)，與不良性狀無必然連鎖；

     5、多為共顯性，能為鑒別純合基因型提供完整的遺傳信息；

     6、操作簡便等。

     這些優(yōu)點使其廣泛應用于生物基因組研究、進化分類、遺傳育種、醫(yī)學和法學等方面，成分分子遺傳學和分子生物學研究與應用的主流技術之一，并且對社會產(chǎn)生巨大沖擊。目前，被廣泛應用的DNA分子標記主要有RFLP（限制性片段長度多態(tài)性）、RAPD(隨機擴增多態(tài)性DNA)、AFLP(擴增片段長度多態(tài)性)、STS（序列標記位點）、SSR或SSLP（簡單重復序列）和DNA指紋技術等。

     總之，遺傳標記的發(fā)展隨遺傳學和科技的發(fā)展而發(fā)展，總的發(fā)展趨勢為由低級到高級、由間接到直接、由粗略到精確。上述前3種遺傳標記均以基因表達結果為基礎，是對基因的間接反映，第4種標記是DNA水平遺傳變異的反映，是對基因的直接反映。4種遺傳標記各有其特點，因此，在遺傳學研究與應用中要注意使其既發(fā)揮各自獨特的作用，又使其互相配合，以發(fā)揮更大的協(xié)同作用。