幾年發(fā)表的三篇論文認為mtDNA存在重組或父系遺傳的可能性而不是完全母系遺傳。有人曾報道在老鼠中發(fā)現(xiàn)mtDNA存在父系遺傳。Hagelberg和Eyre-Walker的論文在mtDNA法醫(yī)和群體遺傳領(lǐng)域引起了軒然大波。后來由于數(shù)據(jù)問題，Hagelberg和他的同事們收回了他們的論文。由于似乎沒有直接的證據(jù)證明，在線粒體基因組之間或內(nèi)部存在重組，這個領(lǐng)域的絕大數(shù)科學(xué)家不再討論這個問題。

    然而，最近發(fā)表的一篇論文發(fā)現(xiàn)在骨骼肌中有人類父系mtDNA型的遺傳，但在其他組織未發(fā)現(xiàn)父系單倍型。對具有類似肌肉疾病的個體的另外幾項研究中也沒有發(fā)現(xiàn)任何mtDNA父系遺傳的證據(jù)。利用過去三十年證明母系遺傳的數(shù)百萬份樣本，可以放心地得到結(jié)論：mtDNA母系遺傳的中心法則是成立的。